Константинопольский Вселенский патриарх прислал в Москву нового митрополита - Исидора, ставшего последним греком на Русской митрополии. В этот раз произошел беспримерный случай, когда кандидатуру русского митрополита выдвинул папа римский, а патриарх только утвердил ее. С Исидором Византийская церковь связывала далеко идущие планы. Боясь турецкого нашествия, ослабевшая Византия искала союзников и поэтому согласилась на предложение о заключении церковной унии с Римской католической церковью, рассчитывая получить поддержку европейских католических стран. Римская церковь посредством унии надеялась подчинить себе Православную церковь. Естественно, Византия и Рим хотели втянуть в борьбу с Турцией и Московское княжество, а Исидор должен был содействовать выполнению этой задачи. Хотя Исидор пробыл в городе всего несколько месяцев, можно считать, что центр Русской церкви вернулся из Смоленска в Москву.